O Hospital Dom Malan é administrado por uma organização social (OS), modelo que o Estado de Pernambuco implantou nas 20 Unidades de Pronto atendimento (UPAs) e em outros três hospitais metropolitanos, inaugurados em 2010. As OS são organizações privadas, que recebem dinheiro público para oferecer tratamento gratuito em saúde. A escolhida por meio de seleção pública para dirigir o Metropolitano Norte foi a Fundação Prof. Martiniano Fernandes.